84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3438 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3438  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0504  phosphatase-like protein  54.5 
 
 		 324 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.32 
 
 		 342 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.06 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.07 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  24.69 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  22.69 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.2 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  23.91 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  23.91 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.05 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.07 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.58 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.12 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.58 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  24.3 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.05 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.34 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.02 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  25 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2839  HAD family hydrolase  48.98 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0722376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  23.42 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  24.56 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.88 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  23.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  24.67 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  22.49 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  22.61 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.62 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.39 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.92 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.56 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  25.11 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  23.56 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  23.95 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  23.56 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  22.59 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.98 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.63 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  23.39 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  23.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.21 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  22.5 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  20.54 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  19.35 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  19.11 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.23 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.67 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  20.52 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0531  hypothetical protein  41.82 
 
 		 98 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  25.12 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.38 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>