121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2164 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  58.67 
 
 		 581 aa  722    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1183    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  22.9 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  25.17 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.9 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  21.91 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.8 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  21.71 
 
 		 608 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  21.81 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.2 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.97 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  23.26 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  22.42 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  22.66 
 
 		 616 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.95 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.88 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  21.48 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  38.2 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  21.08 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  39.33 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  23.72 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  31.88 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.72 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  37.08 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  29.57 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  29.2 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.06 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  30.43 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  29.03 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  22.64 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  24.59 
 
 		 550 aa  57  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  28.65 
 
 		 574 aa  57  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 		 617 aa  56.6  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.45 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  21.72 
 
 		 591 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  22.45 
 
 		 546 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  32.26 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.23 
 
 		 593 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  23.37 
 
 		 570 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  27.81 
 
 		 600 aa  54.7  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  26.98 
 
 		 587 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.81 
 
 		 360 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  23.97 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.42 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.51 
 
 		 709 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  31.78 
 
 		 506 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  31.78 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  31.78 
 
 		 502 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  27.69 
 
 		 594 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  29.41 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.03 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  26.9 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  29.27 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  30.06 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.25 
 
 		 560 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  30.93 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  20.93 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  21.87 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  26.81 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  20.8 
 
 		 530 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  30.85 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  30.69 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  26.63 
 
 		 538 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  29.91 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  23.02 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  30.84 
 
 		 507 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  22.14 
 
 		 581 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  33.75 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  33.02 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  29.81 
 
 		 503 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  32.77 
 
 		 495 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  28.83 
 
 		 500 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  28.03 
 
 		 567 aa  47.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  22.6 
 
 		 559 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  30.84 
 
 		 504 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  37.14 
 
 		 499 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  37.14 
 
 		 499 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  44.78 
 
 		 537 aa  47.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  37.97 
 
 		 526 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  25.47 
 
 		 628 aa  47.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.97 
 
 		 1076 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 498 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  29.81 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.89 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.62 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  32.41 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  30.7 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  30.77 
 
 		 500 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.47 
 
 		 537 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  29.81 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  29.81 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  29.91 
 
 		 520 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 679 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  32 
 
 		 568 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  30.36 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  23.47 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  31.73 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  38.89 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  28.85 
 
 		 511 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>