More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1976 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 112 aa  223  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  71.17 
 
 		 114 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.04 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 673 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 653 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 662 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 690 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 634 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 628 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 672 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 654 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 629 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 629 aa  104  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 642 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.67 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 671 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 628 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 693 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  46.9 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 663 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 711 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.56 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.56 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 660 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 659 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 679 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 640 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 647 aa  96.7  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 647 aa  96.7  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 670 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 648 aa  95.9  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 650 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 663 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 669 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 660 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 642 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 638 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 634 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 632 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 682 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 688 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 629 aa  92.8  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 664 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 650 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 642 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 653 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 705 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 657 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 657 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 690 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 666 aa  90.9  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 677 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 702 aa  90.1  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 656 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 651 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 678 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 680 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 674 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 702 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 699 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 654 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 675 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 680 aa  89  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 698 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 676 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 645 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 683 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 686 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  40.74 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 645 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 688 aa  88.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 690 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2554  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 675 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0924  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 689 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 676 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 636 aa  87.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 675 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 710 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 680 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 688 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 676 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 676 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 657 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 645 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 676 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 677 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3197  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 675 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000166166  decreased coverage  0.00110356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 677 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 670 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2449  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 694 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0120068  normal  0.754199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 692 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 692 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>