More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2199 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  100 
 
 
316 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  55.49 
 
 
312 aa  316  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  48.58 
 
 
303 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.66 
 
 
300 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  47.76 
 
 
308 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  52.21 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.06 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  52.31 
 
 
456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  50.77 
 
 
459 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50 
 
 
457 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.05 
 
 
387 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.04 
 
 
446 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.64 
 
 
411 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.23 
 
 
455 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50.39 
 
 
455 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  48.84 
 
 
229 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.17 
 
 
238 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  48.25 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.3 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  52.99 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.72 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  49.23 
 
 
454 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.89 
 
 
400 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  48.53 
 
 
271 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  45.52 
 
 
404 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  39.44 
 
 
452 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.44 
 
 
450 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  45.74 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.8 
 
 
216 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.55 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.72 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.06 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  51.75 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  46.22 
 
 
423 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.46 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.27 
 
 
447 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.27 
 
 
447 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.51 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  45.9 
 
 
459 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  44.74 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  48.84 
 
 
523 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  48 
 
 
529 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  50 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  48.31 
 
 
431 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  49.14 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.14 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  40.23 
 
 
582 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  40.6 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50.39 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.68 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  48.76 
 
 
491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.75 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.83 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.75 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.87 
 
 
482 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  50.42 
 
 
414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  47.2 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.45 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  48.44 
 
 
442 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  45.74 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  46.72 
 
 
402 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48.06 
 
 
233 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  30.6 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  29.88 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  50 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  46.97 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  48.33 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  44.72 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  50 
 
 
437 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.84 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  46.21 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  50 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  49.56 
 
 
524 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  33.51 
 
 
230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  48.72 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.21 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  39.34 
 
 
295 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  31.18 
 
 
325 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.86 
 
 
445 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  49.57 
 
 
299 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.61 
 
 
238 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  44.53 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  32.59 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  47.46 
 
 
430 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  36.05 
 
 
334 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  44.27 
 
 
288 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  50 
 
 
402 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  52.21 
 
 
687 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.38 
 
 
443 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  41.46 
 
 
282 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  46.21 
 
 
474 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.47 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  47.86 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  42.86 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  49.57 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  44.63 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.15 
 
 
430 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  31.87 
 
 
299 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  41.67 
 
 
341 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  48.74 
 
 
137 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>