More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4794 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4794  response regulator receiver protein  100 
 
 
462 aa  858    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
873 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1204 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1275 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
822 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
816 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2344  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 
135 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1525  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
127 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1620  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
127 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0904485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  35.96 
 
 
794 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1490 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  36.75 
 
 
945 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
611 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
781 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  32.23 
 
 
602 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  32.23 
 
 
602 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
1480 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.65 
 
 
853 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1110 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
899 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  40.83 
 
 
918 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  32.77 
 
 
602 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.25 
 
 
1442 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  34.21 
 
 
955 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1548 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1029 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
944 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  36.52 
 
 
656 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  38.52 
 
 
519 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  31.62 
 
 
553 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
1193 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
759 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  30.25 
 
 
732 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
502 aa  60.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
127 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  36.72 
 
 
779 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
695 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1333 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0893  two component sensor kinase  32.77 
 
 
554 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
517 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
662 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
877 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
801 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1087 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
946 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
924 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1326 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1436 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  31.01 
 
 
1286 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.48 
 
 
655 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  30.17 
 
 
764 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
720 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1407 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
947 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 
124 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1245 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1202 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1436 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1478 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1333 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1286  Hpt protein  43.04 
 
 
121 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1049 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  40.16 
 
 
918 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
643 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  34.84 
 
 
1071 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1025  Hpt protein  40.57 
 
 
171 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
865 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
643 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1088 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1032 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
876 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1113 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
843 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
687 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
933 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  33.63 
 
 
933 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3157  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
859 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1203 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.4 
 
 
915 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.63 
 
 
949 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  31.62 
 
 
671 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
910 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.4 
 
 
948 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  29.69 
 
 
1026 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.4 
 
 
948 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.4 
 
 
948 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
153 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 
120 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.4 
 
 
948 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  31.3 
 
 
1023 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
656 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
231 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.88 
 
 
121 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
964 aa  57  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>