226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4452 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
346 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 
376 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
337 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  34.26 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
331 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
334 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 
447 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
331 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 
323 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 
350 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
475 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
325 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
311 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.91 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
443 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 
340 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.49 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.28 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  27.66 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.66 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  28.14 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  24.35 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  31.39 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  28.22 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  28.51 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.32 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.8 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  26.57 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  24.33 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  26 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  25.44 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.56 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  27.05 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  27.36 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  26.02 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  26.02 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  26.04 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  26.02 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  26.02 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  26.02 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  26.02 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  24.04 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  25.73 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  25.09 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>