More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0230 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  100 
 
 		 498 aa  984    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  67.47 
 
 		 498 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  60.92 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  49.29 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  50.31 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  50.72 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  53.88 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  52.1 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  52 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  50.31 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  50.51 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  51.12 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  49.59 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  48.47 
 
 		 522 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  48.74 
 
 		 506 aa  359  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  45.69 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  42.17 
 
 		 477 aa  349  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  42.98 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  42.58 
 
 		 472 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  43.63 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  44.4 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  46.97 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  42.68 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  40.49 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.3 
 
 		 479 aa  297  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  42.55 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  41.18 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  41.84 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  44.93 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  42.06 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  40.93 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  41.25 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  41.25 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  41.25 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  37.85 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  40.62 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  40.81 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  40.83 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  40.9 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  38.59 
 
 		 490 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  37.87 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  41.14 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  38.59 
 
 		 490 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  40.21 
 
 		 494 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  38.88 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  37.98 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  40.38 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  41.18 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  40.09 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  36.04 
 
 		 487 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  39.7 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  39.87 
 
 		 480 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  39.09 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  37.63 
 
 		 480 aa  240  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  37.16 
 
 		 492 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  38.15 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  36.97 
 
 		 485 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.76 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  38.23 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.89 
 
 		 475 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  39.37 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  37.39 
 
 		 556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  36.4 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  38.75 
 
 		 497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  39.87 
 
 		 459 aa  233  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  37.9 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  35.88 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  34.97 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  37.14 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  37.14 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  37.14 
 
 		 497 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  37.14 
 
 		 546 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  37.14 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  37.14 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  37.14 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  37.55 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  33.54 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  36.25 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.5 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.71 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.09 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  36.67 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.09 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  37.12 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.88 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  36.19 
 
 		 495 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.91 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.98 
 
 		 475 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.46 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  37.66 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  35.58 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.73 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  35.86 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.75 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.36 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.73 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  33.9 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  35.07 
 
 		 474 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.57 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>