More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2402 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  97.62 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  97.62 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  88.83 
 
 		 202 aa  360  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 203 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  78.57 
 
 		 203 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  68.23 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  65.35 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  66.15 
 
 		 202 aa  264  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  67.38 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  63.05 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  64.06 
 
 		 201 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  65.1 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  65.62 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  63.87 
 
 		 198 aa  251  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  62.77 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  62.77 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  63.1 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  64.17 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  63.64 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  60.22 
 
 		 192 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  56.91 
 
 		 189 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  63.64 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  60.11 
 
 		 248 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  57.51 
 
 		 251 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  56.25 
 
 		 250 aa  205  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  56.25 
 
 		 250 aa  205  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  48.69 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 		 239 aa  204  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  56.83 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  52.6 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  53.68 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  58.47 
 
 		 243 aa  197  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  53.68 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  49.52 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  53.44 
 
 		 243 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  52.91 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  48.02 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.2 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.2 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  46.89 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.8 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  53.38 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.98 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  50.34 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  47.4 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  50.6 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  47.4 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.12 
 
 		 183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.11 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  37.27 
 
 		 365 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  41.81 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  35 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  46.88 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.52 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.51 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  48.19 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>