94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3668 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  100 
 
 		 321 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  64.4 
 
 		 311 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  63.17 
 
 		 315 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  62.7 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  52.6 
 
 		 320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  50.17 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  51.21 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  50.35 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  50.35 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  35.26 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  35.26 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  31.56 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  30.42 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  32.12 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  31.15 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  32.95 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  33.07 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  32.33 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  28.57 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.82 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  29.61 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  37.5 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  29.25 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  29.25 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  30.59 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  29.25 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  30.97 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  30.84 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  32.44 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  28.01 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.57 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.58 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  26.91 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  29.2 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  26.6 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  26.23 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.54 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  26.21 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  26.58 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  32.51 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  25.58 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  26.89 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  25.32 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  25.65 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  26.07 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  25.22 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  25.14 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  24.36 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  25.65 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  23.8 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  25.3 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  25.22 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  22.86 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  25.29 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  25.76 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  25.76 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.52 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  34.07 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.55 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.15 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  23.05 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  23.39 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  27.86 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  22.69 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  22.86 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  23.03 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  21.31 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  24.16 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  24.16 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.85 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.9 
 
 		 221 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  30.49 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0509  cyclase family protein  28.37 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.876245  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.89 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.53 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.08 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  37.5 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  25.54 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  29.82 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  31.71 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1342  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  31.17 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.03 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3839  cyclase family protein  29.19 
 
 		 183 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.302477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  25.71 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>