210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3287 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  56.72 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  55.1 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  57.03 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.62 
 
 		 358 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  51.28 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  54.69 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  44.18 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  52.02 
 
 		 285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  56.92 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  47.6 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  45.49 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  41.18 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  44.08 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  46.12 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  44.49 
 
 		 367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  44.84 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  44.94 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  44.23 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  43.55 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  43.72 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  43.09 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  44.13 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  40.64 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  38.13 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  38.13 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  44.18 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  41.39 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  41.25 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  37.96 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  41.94 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  40.16 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  41.7 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  42.86 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  39.37 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  41.63 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  44.35 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  40.08 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  44.53 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  42.51 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  42.11 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  43.2 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  38.71 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  44.8 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  43.82 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  42.64 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  40.89 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  42.97 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  37.14 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  37.14 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  42.69 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  36.73 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  36.08 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  40.89 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  42.74 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  43.27 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  41.27 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  42.91 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  42.17 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  55.56 
 
 		 332 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  40.65 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  38.87 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  42.86 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  54.86 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  40.49 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  38.49 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  37.75 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  36.33 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  43.55 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  35.71 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  40.82 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  41.7 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  42.04 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  42.04 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  42.04 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  44.58 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  54.42 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.76 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  43.25 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  34.57 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  42.35 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.76 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  41.63 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  35.77 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  36.59 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  37.7 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  36.55 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  42.97 
 
 		 281 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  39.34 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  38.37 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  38.37 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  39.68 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  37.55 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  37.55 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  41.63 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  37.55 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  41.44 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  37.55 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  41.5 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  43.72 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>