More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1478 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  793    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  75.95 
 
 		 406 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 410 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  50.25 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  50.5 
 
 		 404 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  50.5 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  50.5 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  42.86 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.64 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  43.18 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  43.18 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  43.18 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  43.18 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  43.18 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  43.07 
 
 		 409 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  43.64 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 403 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  43.48 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  41.16 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  43.22 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  43.22 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  43.22 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  40 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 487 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  42.97 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  40.2 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  39.69 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  39.27 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  38.74 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 407 aa  278  9e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  37.04 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  37.86 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  42.9 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  37.01 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  40.05 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  35.22 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 407 aa  206  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.38 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.13 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.94 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.96 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.75 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  24.87 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.03 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.32 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.5 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.8 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.25 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  23.94 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>