84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8435 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.47 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  68.35 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  64.71 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  67.63 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  64.03 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  64.75 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  64.96 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  65.08 
 
 		 138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  53.68 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  51.88 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.56 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.71 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  48.92 
 
 		 137 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  54.03 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  49.64 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.13 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.99 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.99 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.07 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.27 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  52.34 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  42.65 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  53.15 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  45.87 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  48.18 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  48.18 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  48.18 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  47.27 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  46.49 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  37.6 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  46.49 
 
 		 318 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  48.42 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  45.98 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  45.71 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.84 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.5 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  37.37 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  33.6 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  33.07 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  33.65 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.17 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  36.27 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  34.69 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  45.21 
 
 		 239 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  33.33 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  32.23 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  42.47 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.11 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.9 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  37.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  37.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  41.67 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 109 aa  42  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  27.48 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  27.86 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  32.2 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36928  predicted protein  32.95 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  35.16 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 		 236 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 		 231 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>