More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2085 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2085  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
473 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.217436  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  28.26 
 
 
481 aa  113  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  25.34 
 
 
503 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
490 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  28.12 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  26.17 
 
 
487 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  26.17 
 
 
487 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  25.5 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  26.17 
 
 
487 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.95 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.8 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  25.84 
 
 
487 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  25.84 
 
 
487 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.85 
 
 
269 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 
487 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  34.12 
 
 
541 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  26.3 
 
 
487 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  24.04 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  34.88 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
490 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 
268 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 
521 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
483 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  34.71 
 
 
521 aa  90.9  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  27.51 
 
 
524 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  23.63 
 
 
487 aa  90.5  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  27.51 
 
 
494 aa  90.5  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  27.51 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 
486 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 
470 aa  90.1  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 
293 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  26.1 
 
 
484 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.51 
 
 
605 aa  89.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  34.59 
 
 
270 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
266 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 
521 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.37 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 
461 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 
269 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 
269 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  27.78 
 
 
561 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
553 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  23.98 
 
 
484 aa  87.4  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 
268 aa  87  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  32.32 
 
 
270 aa  87  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
569 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  27.84 
 
 
588 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  27.84 
 
 
588 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  27.06 
 
 
269 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  34.91 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  27.84 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  25.1 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.73 
 
 
573 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  24.22 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 
269 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 
269 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  27.84 
 
 
589 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.25 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
564 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
567 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  27.84 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  27.84 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  27.84 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  27.84 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  27.84 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  27.84 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 
269 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  27.84 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  25.66 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  24.75 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 
588 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 
262 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  30.29 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  27.32 
 
 
593 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  27.21 
 
 
504 aa  83.2  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  24.73 
 
 
280 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  24.62 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  26.48 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  26.15 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>