57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0287 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  39.78 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  40.78 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  42.7 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  40 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  40 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  40.46 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  40.88 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  43.5 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  40.11 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  41.86 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  38.32 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  33.92 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  31.37 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 259 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  27.27 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 216 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 205 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 248 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>