100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3386 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  100 
 
 		 125 aa  257  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.7 
 
 		 502 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  38.57 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  32.14 
 
 		 509 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  39.8 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  43.04 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  37.1 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  32.71 
 
 		 487 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  37.18 
 
 		 672 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  35.82 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  35.82 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  29.17 
 
 		 491 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  34.41 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  32 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 		 517 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 537 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 		 512 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 		 537 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  28.16 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  37.04 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  41.18 
 
 		 629 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  28.71 
 
 		 490 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  43.4 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  26.96 
 
 		 490 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  29.84 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  33.96 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 497 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  27.2 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.35 
 
 		 507 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 538 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  25.23 
 
 		 505 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  43.14 
 
 		 537 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  33.96 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  35.85 
 
 		 546 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  33.96 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 		 483 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  29.59 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 540 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  34.85 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  29.59 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  29.59 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  28.38 
 
 		 577 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  29.35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  27.27 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  23.39 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  38.55 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 504 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  30.34 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  35.62 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  25.76 
 
 		 571 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  25 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  38.3 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  35.06 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  37.04 
 
 		 272 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 510 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 		 523 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  31.15 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 488 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 523 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  35.94 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 488 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 488 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  27.18 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  30.48 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  33.78 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  35.42 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  27.18 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  35.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  39.62 
 
 		 94 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>