132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4270 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  69.62 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  68.06 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  65.28 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  55.32 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  52.53 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  54.84 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  47.19 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  62.86 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  47.37 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  48.42 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  52 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  57.75 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  51.85 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  54.79 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  58.9 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  53.09 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  53.52 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  41.49 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  53.33 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  53.33 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  53.33 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  53.42 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  52.78 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  60.29 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  51.43 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  52.11 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  52.11 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  51.43 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  52.11 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  43.37 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  40.22 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  40.96 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  52.05 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  52.86 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  44.79 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  45.07 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  48.57 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  43.37 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  44 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  44.16 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  45.12 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  48.65 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  45.59 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  44.3 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  46.58 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  46.58 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  41.56 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  46.55 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  39.19 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  36.99 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  41.1 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  48.35 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  48.19 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  37.88 
 
 		 490 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  41.27 
 
 		 497 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 523 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 523 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 523 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  42.65 
 
 		 521 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  32.94 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  39.73 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  46.59 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  45.28 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  43.08 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1880  hypothetical protein  32.95 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0613491  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  45.28 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  48.28 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  40.58 
 
 		 540 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  40.3 
 
 		 509 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  36.92 
 
 		 491 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 487 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  35.82 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 513 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>