151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1332 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  225  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  45.87 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  48.94 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 		 538 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  35.14 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  42.67 
 
 		 546 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.04 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.04 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  31.82 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 504 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  50.75 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  31.82 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  33.91 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  31.62 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  34.04 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  34.04 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  32.48 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  40.79 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  34.55 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  41.79 
 
 		 537 aa  57.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  39.47 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.33 
 
 		 512 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 		 523 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  39.13 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  36.23 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  36.23 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  32.74 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  45.28 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  42.31 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  38.57 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  42.25 
 
 		 507 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  43.94 
 
 		 509 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  47.27 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  35.94 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  30.7 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  29.2 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  36.23 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  40.91 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 500 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  32 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 517 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  41.79 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  37.88 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  42.42 
 
 		 509 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 487 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 513 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 507 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  42.59 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  39.44 
 
 		 507 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  40.59 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  42.19 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  39.73 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 490 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  34.78 
 
 		 571 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  40.74 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  35.37 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  36.27 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  34.72 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  41.79 
 
 		 545 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  37.5 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  40.91 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  37.66 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  37.88 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 523 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  41.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32.39 
 
 		 490 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 523 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  36.71 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 505 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 523 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.5 
 
 		 488 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  32.5 
 
 		 488 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>