93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0654 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  100 
 
 		 110 aa  227  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  98.18 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  98.18 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  98.18 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  97.27 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  97.27 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  97.27 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  97.27 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  45.76 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  47.01 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  46.15 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  38.16 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  41.89 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  39.71 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  30.39 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  40.62 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  32.32 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  33.66 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  32.26 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  35.82 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  34.26 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  37.93 
 
 		 537 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  39.19 
 
 		 523 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 537 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 		 537 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  41.67 
 
 		 490 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  30.88 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 546 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  36.92 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 		 502 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  31.87 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 		 538 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  30.21 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  27.72 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  29.85 
 
 		 504 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 540 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  40 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  28.57 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  24.51 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  38.98 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  26.14 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 517 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 		 512 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  47.22 
 
 		 629 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  30.12 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.91 
 
 		 510 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  44.23 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  36.21 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  36.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  27.18 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  34.18 
 
 		 542 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  28.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  26.56 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  27.54 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  26.56 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 483 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.34 
 
 		 500 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  30.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  29.03 
 
 		 571 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  27.4 
 
 		 490 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.64 
 
 		 510 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 487 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.85 
 
 		 507 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  36.07 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  39.53 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  40.54 
 
 		 672 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  37.25 
 
 		 115 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  32.73 
 
 		 505 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>