131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0023 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  60.68 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  52.94 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  41.57 
 
 		 490 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  43.21 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  40.52 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  36.63 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.67 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  39.29 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  38.14 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  40.17 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  46.77 
 
 		 523 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  40.54 
 
 		 545 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  34.75 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  42.05 
 
 		 546 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  49.06 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  45.16 
 
 		 483 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  41.77 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  39.51 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  35.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  36.67 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  28.83 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  46.3 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.44 
 
 		 510 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  49.09 
 
 		 537 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  40.3 
 
 		 505 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  41 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 517 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  40.28 
 
 		 542 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.74 
 
 		 512 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  41.89 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  31.3 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  36.05 
 
 		 521 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  44.29 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  31.4 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  40.54 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.19 
 
 		 507 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  41.89 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.59 
 
 		 510 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  41.43 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  37.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  39.73 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  42.59 
 
 		 513 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  41.03 
 
 		 537 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  46.55 
 
 		 552 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  39.19 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  36.46 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  36.79 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  38.24 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  43.1 
 
 		 538 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36 
 
 		 497 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  29.6 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  39.47 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  41.3 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  41.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.38 
 
 		 537 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  41.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  38.82 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  32.18 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  36.11 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  43.4 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  36.51 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  31.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  34.52 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  34.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  32.86 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  39.66 
 
 		 487 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  43.86 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>