148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1326 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  39.51 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  36.96 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  39.71 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  38.27 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  40.3 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  38.27 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  38.27 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  35.05 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  40.28 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  40.35 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  37.97 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  34.78 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  40.51 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  34.78 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  40.51 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  34.78 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  29.46 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.65 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  40.51 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.25 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  37.31 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  39.47 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  38.16 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  43.94 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  41.18 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.65 
 
 		 517 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  34.88 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  37.88 
 
 		 523 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  38.81 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 		 537 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  36.11 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  34.48 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  40.58 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  34.12 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  34.12 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 502 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  38.16 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  32.94 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  36.23 
 
 		 272 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  30.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  33.87 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  34.95 
 
 		 538 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  39.13 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  32.91 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  32.61 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  43.55 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  43.14 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  26.58 
 
 		 577 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  41.51 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  32.18 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  43.4 
 
 		 491 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  34.52 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 509 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  32.84 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 509 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  36.23 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  31.86 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  30.63 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  32.89 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  33.33 
 
 		 490 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 506 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 546 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  32.84 
 
 		 507 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 507 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 483 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  31.34 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 507 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>