102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2428 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  92.5 
 
 		 120 aa  227  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  78.33 
 
 		 120 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  78.33 
 
 		 120 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  67.77 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  39.29 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  32.17 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  36.45 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 537 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 538 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  34.91 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 540 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.87 
 
 		 517 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  32.46 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  30.49 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  33.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  37.84 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 537 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  36.99 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 512 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  39.47 
 
 		 490 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  37.88 
 
 		 513 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  32.95 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  30.7 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 		 483 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 509 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  27.16 
 
 		 577 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  28.21 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  28.57 
 
 		 672 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  30.99 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  33.68 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 502 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  27.97 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  27.03 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  25.42 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  30.85 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  35.06 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  30.14 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  32.14 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  41.77 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 509 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  41.77 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  41.77 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  36.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  29.23 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 500 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  29.51 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  31.43 
 
 		 513 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  28.21 
 
 		 505 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 506 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  32.47 
 
 		 545 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  39.22 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  32.35 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1154  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  29.35 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  28.17 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  30.56 
 
 		 123 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  34.92 
 
 		 523 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 510 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  27.63 
 
 		 571 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0260  periplasmic copper-binding protein  31.34 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  32.84 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  31.34 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  27.68 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  26.09 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  32.84 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 507 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  34.25 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  23.47 
 
 		 110 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  29.21 
 
 		 629 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>