77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4635 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  60.24 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  54.93 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  48.72 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  46.34 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  36.56 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  49.32 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  46.34 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  46.34 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  46.58 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  47.95 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  48.61 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  52.11 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  45.88 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  40.96 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  43.59 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  42.31 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  43.84 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  44.29 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  44.29 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  47.89 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  42.17 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  44.3 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  42.31 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  44.3 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  43.37 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  40.54 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  43.24 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  43.24 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  40.54 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  40.51 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  39.19 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  41.77 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  39.74 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  40.54 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  38.67 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  38.67 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  39.74 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  38.96 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  37.84 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  38.03 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  37.66 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  40.79 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  41.89 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  33.73 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  40.79 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  41.79 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  31.96 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  36.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 540 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  35.06 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  36.23 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  32.91 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  32.91 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.67 
 
 		 512 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  29.69 
 
 		 491 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 517 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  32.39 
 
 		 490 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>