139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3489 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  75.42 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  55.45 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  50.43 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  46.28 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  45.3 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  67.12 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  62.86 
 
 		 272 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  50.86 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  53.33 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  44.35 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  47.83 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  62.5 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  44 
 
 		 136 aa  94.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  56.25 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  52.53 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  41.94 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  43.7 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  46.46 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  43.97 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  43.97 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  47.06 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  57.97 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  50.7 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  57.53 
 
 		 94 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  51.35 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  51.85 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  53.95 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  54.41 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  55.88 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  48.65 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  47.44 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  52.17 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  45.21 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  50.7 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  40.4 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  45.95 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  45.95 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  52.31 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  32.5 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  49.28 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  39.24 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  39.24 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  39.24 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  45.95 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  47.76 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  40.28 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  44.78 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  54.72 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  42.19 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  27.93 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  27.93 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  42.19 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  42.19 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  42.19 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  42.19 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  42.19 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  42.19 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  54.72 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  49.28 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  36.71 
 
 		 490 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  46.97 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  44.29 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  42.11 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  39.44 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  36.62 
 
 		 491 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  31.3 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 512 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 537 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.8 
 
 		 517 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  42.03 
 
 		 540 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 538 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  40.3 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  39.68 
 
 		 523 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  32.95 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  32.95 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  32.5 
 
 		 546 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>