135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1463 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  226  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  69.3 
 
 		 114 aa  167  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  60.53 
 
 		 113 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  60.36 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  47.97 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  57.5 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  47.95 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  54.79 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  55.7 
 
 		 272 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  53.42 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  43.62 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  55.56 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  44.58 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  39.09 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  39.09 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  47.14 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  47.14 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  42.31 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  39.81 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  42.31 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  40.87 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  46.48 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  48.68 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  44.87 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  39.77 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  35.09 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  38.67 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  43.68 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  42.25 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  47.89 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  36.47 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  36.21 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  38.89 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  47.95 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  42.31 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  43.04 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  35.19 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  35.19 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  35.19 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  42.42 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  35.19 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  37.76 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  34.26 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  34.26 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  34.26 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  43.28 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  35.21 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  33.66 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  33.66 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 546 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  41.51 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  34.26 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.8 
 
 		 517 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  43.28 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.57 
 
 		 512 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  43.06 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 537 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 538 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1857  hypothetical protein  39.73 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  39.68 
 
 		 523 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  35.9 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  28.97 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  31.19 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>