98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2045 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  55.26 
 
 
116 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  55.26 
 
 
116 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  51.69 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  51.69 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  51.72 
 
 
122 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  57.58 
 
 
122 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  65.33 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  61.43 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  61.43 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  61.43 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  48.62 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  52.75 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  60.87 
 
 
114 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  38.74 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  40.37 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  40.37 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  40.37 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  53.52 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  38.26 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  43.36 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  43.36 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  46.99 
 
 
121 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  48.57 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  49.28 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  37.72 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  52.94 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  36.52 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  44.93 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  46.05 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  46.05 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  38.82 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  36.96 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  42.19 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  44.94 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  48.72 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  42.03 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  37.04 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  34.52 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  44.93 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  46.97 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  34.55 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1645  conserved hypothetical signal peptide protein  50.77 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191944  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5286  putative signal peptide protein  50.77 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.903888  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  27.43 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  47.76 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  45.71 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  41.79 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  36.11 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  41.79 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  40.3 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  44.62 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  44.62 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  39.13 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  37.14 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  43.08 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  37.14 
 
 
236 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  37.31 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  41.33 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  41.54 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  38.67 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  40.58 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  44.78 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  37.38 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  34.78 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  38.81 
 
 
122 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  26.32 
 
 
116 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  40.38 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  33.33 
 
 
490 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  37.74 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  40.38 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  38.75 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  32.81 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 
513 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 
486 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 
487 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0168  hypothetical protein  25.38 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
488 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  34 
 
 
546 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  39.06 
 
 
497 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>