73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0168 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0168  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  29.49 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  34.78 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  31.88 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  31.08 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  34.25 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  34.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  32.84 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  36.49 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  31.34 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  32.86 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  25.25 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  30.12 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  30.12 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  28.12 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  30.12 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  38.1 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  29.11 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  29.49 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  32.39 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  26.58 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  32.39 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  36.76 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  28.17 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  33.85 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  31.51 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  35.29 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1645  conserved hypothetical signal peptide protein  36.76 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  32.81 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5286  putative signal peptide protein  36.76 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.903888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  34.29 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  28.95 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  28.36 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  24.62 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  35.82 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  35.85 
 
 		 546 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  25.88 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  29.58 
 
 		 105 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 114 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  21.97 
 
 		 491 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  33.96 
 
 		 537 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  28.77 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  36 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  36 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  29.36 
 
 		 505 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  28.12 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  34.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  30.67 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>