108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6281 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
116 aa  227  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  87.07 
 
 
116 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  65 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  65 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  65.52 
 
 
122 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  70.3 
 
 
122 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  69 
 
 
121 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  62.61 
 
 
115 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  60 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  56.76 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  56.76 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  56.76 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  68.49 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  69.44 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  69.44 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  69.44 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  69.44 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  69.44 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  69.44 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  49.14 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  63.33 
 
 
114 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  46.9 
 
 
115 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  45.13 
 
 
116 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  46.02 
 
 
116 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  46.55 
 
 
115 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  50.47 
 
 
123 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  45.13 
 
 
118 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  52.75 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  45.54 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  56.94 
 
 
111 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  47.37 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  54.17 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  47.25 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  42.05 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  39.76 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  39.76 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  44.93 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  43.66 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  44.93 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  35.58 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5286  putative signal peptide protein  40.87 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.903888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  40.66 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1645  conserved hypothetical signal peptide protein  40.87 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191944  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  38.55 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  40.87 
 
 
114 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  38.6 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  44.93 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  44.78 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  44.93 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  37.84 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  39.18 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  38.74 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  44.74 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  44.74 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  43.42 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  30.97 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  42.47 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  42.47 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  42.86 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  34.21 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  45.68 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  43.48 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  47.76 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  44 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  36.67 
 
 
272 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  32.89 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  47.69 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  43.08 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  38.24 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  49.28 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  34.34 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  43.04 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  39.74 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  34.78 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  44.23 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  44.59 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  42.31 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  42.31 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  34.34 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  37.66 
 
 
546 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0168  hypothetical protein  27.63 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 
486 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  26.09 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  34.29 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  32.98 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  32.98 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  32.98 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  38.98 
 
 
490 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  26.09 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  39.34 
 
 
537 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>