83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1674 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  45.45 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  36.84 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  30.43 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  37.33 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  43.1 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  25.45 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  35.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  37.18 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 		 272 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  41.07 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  37.68 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  29.81 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  35.53 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  34.21 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  33.82 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  33.75 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  39.71 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  31.17 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  37.88 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  32.39 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  35.53 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  30.86 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  30.26 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  29.41 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1880  hypothetical protein  32.97 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0613491  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  30.86 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  32.5 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  31.88 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  30.26 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  32.35 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  32.86 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  29.41 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  27.18 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  31.88 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  37.68 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  37.14 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1857  hypothetical protein  34.21 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  33.75 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  33.75 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  33.75 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  35.21 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  38.18 
 
 		 486 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  31.51 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  35.94 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  36.36 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  34.78 
 
 		 98 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>