54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1880 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  276  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0613491  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1857  hypothetical protein  66.67 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  42.42 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  34.41 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  30.59 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  30.14 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  33.8 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  32.43 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  32.05 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  34.18 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  32.81 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  35.62 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  31.75 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  36.76 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  34.25 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  38.98 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  30.43 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  33.78 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  32.31 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  32.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  33.85 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  34.85 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  34.85 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  30.88 
 
 		 105 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 118 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  32.31 
 
 		 118 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  33.75 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  36.51 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  31.15 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  31.34 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  32.31 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  39.29 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>