More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1789 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  534  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.75 
 
 
277 aa  523  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.95 
 
 
277 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281492  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.07 
 
 
277 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.316827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  48.12 
 
 
299 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  47.94 
 
 
301 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
294 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.94 
 
 
301 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
278 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.36 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 
294 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
295 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
276 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  49.06 
 
 
280 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  44.85 
 
 
298 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  44.32 
 
 
300 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
298 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
281 aa  236  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  47.96 
 
 
274 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
290 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
278 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
272 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
293 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00518726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.9 
 
 
288 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  44.32 
 
 
300 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
285 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0363  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.17 
 
 
283 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
317 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
283 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
281 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0874142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
399 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5272  histidine ABC transporter, permease protein, putative  43.12 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4830  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.12 
 
 
283 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5829  ABC transporter permease  41.82 
 
 
283 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
383 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4110  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.04 
 
 
662 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67280  ABC transporter permease  41.82 
 
 
283 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0674  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000586111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2476  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.41 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
283 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
400 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
292 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.679353  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
283 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0151467  normal  0.023955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
283 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
283 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2929  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter permease  49.77 
 
 
415 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
400 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16981  ABC transporter,membrane component, glycine betaine/proline family protein  44.78 
 
 
304 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7253  ABC transporter  40.37 
 
 
282 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
282 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000739779  decreased coverage  0.0000000000305889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0615  glycine betaine ABC transporter, binding protein inner membrane component  41.92 
 
 
356 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00230108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
281 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
276 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3282  ABC transporter membrane spanning protein (proline/glycine betaine)  43.07 
 
 
281 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
281 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730123  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4710  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.42 
 
 
281 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0463  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
281 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
300 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2844  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.852577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
277 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003610  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  42.13 
 
 
363 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24580  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  40.07 
 
 
303 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
283 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26210  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  44.69 
 
 
310 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
283 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000490097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
451 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
278 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2824  choline ABC transporter, permease protein  41.95 
 
 
281 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730549  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.01 
 
 
409 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  41.6 
 
 
374 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
281 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
278 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0116658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0896  glycine betaine transporter membrane protein  40.53 
 
 
392 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.652731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
376 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.197638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
289 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3093  choline ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1796  amino acid ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
575 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.135141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.1 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659983  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2074  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  41.82 
 
 
291 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.728826  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  41.29 
 
 
298 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06177  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  39.93 
 
 
280 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  39.39 
 
 
400 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>