More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1421 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  95.7 
 
 
279 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  94.98 
 
 
279 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  77.78 
 
 
279 aa  448  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  53.28 
 
 
279 aa  285  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
313 aa  205  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  36.67 
 
 
291 aa  198  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  38.22 
 
 
315 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  34.07 
 
 
320 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  35.23 
 
 
291 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  32.96 
 
 
315 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  32.22 
 
 
331 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  32.43 
 
 
281 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  28.12 
 
 
302 aa  106  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  27.65 
 
 
250 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  29.71 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  27.69 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.12 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.41 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  27.36 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.25 
 
 
426 aa  72  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  26.94 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.33 
 
 
155 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.76 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.29 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  31.85 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.56 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.28 
 
 
769 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
873 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.23 
 
 
907 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  28.91 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.14 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.4 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.02 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 
135 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.68 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.26 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  28.15 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.3 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  34.13 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.43 
 
 
216 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  28.12 
 
 
142 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  25 
 
 
880 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.22 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  31.71 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  28.33 
 
 
696 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  24.62 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.85 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  28.26 
 
 
382 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  30 
 
 
488 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  31.58 
 
 
513 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  26.02 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  24.9 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
486 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  33.07 
 
 
640 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.28 
 
 
147 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  22.62 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  26.62 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.52 
 
 
153 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  35.16 
 
 
502 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.75 
 
 
132 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 
698 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.42 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
149 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  22.99 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  28.26 
 
 
382 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.86 
 
 
873 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
137 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  34.11 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  25.28 
 
 
262 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
154 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.86 
 
 
845 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.82 
 
 
220 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>