More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1256 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  100 
 
 
590 aa  1204    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  97.46 
 
 
590 aa  1174    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  97.29 
 
 
590 aa  1173    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  82.88 
 
 
590 aa  1035    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  77.59 
 
 
592 aa  951    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  51.61 
 
 
589 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  52.12 
 
 
586 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  53.91 
 
 
589 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  51.45 
 
 
590 aa  597  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  52.12 
 
 
588 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  51.45 
 
 
589 aa  593  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
604 aa  588  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
604 aa  588  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  49.92 
 
 
606 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  51.53 
 
 
584 aa  585  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  51.43 
 
 
601 aa  587  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  50.09 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  48.51 
 
 
609 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  50.08 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  47.07 
 
 
600 aa  564  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  47.36 
 
 
610 aa  558  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
600 aa  548  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  46.33 
 
 
604 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  44.64 
 
 
623 aa  528  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  44.35 
 
 
595 aa  528  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  46.46 
 
 
590 aa  527  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.71 
 
 
590 aa  523  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  45.68 
 
 
611 aa  521  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  45.38 
 
 
590 aa  518  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  45.68 
 
 
611 aa  521  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.98 
 
 
603 aa  511  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.29 
 
 
589 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  43.37 
 
 
564 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  23.5 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.26 
 
 
489 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  23.32 
 
 
643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  26.27 
 
 
645 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  26.64 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  25.59 
 
 
644 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.56 
 
 
556 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  24.95 
 
 
643 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 
502 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  25.59 
 
 
466 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  25.59 
 
 
466 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.94 
 
 
495 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  24.66 
 
 
643 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  22.95 
 
 
634 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 
539 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  22.7 
 
 
914 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.31 
 
 
560 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  26.9 
 
 
555 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.06 
 
 
555 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  25.21 
 
 
540 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.51 
 
 
583 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  24.75 
 
 
555 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.65 
 
 
537 aa  101  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  25.51 
 
 
573 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 
555 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.86 
 
 
913 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  31.03 
 
 
259 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.72 
 
 
561 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.76 
 
 
555 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  25.11 
 
 
478 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 
560 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.28 
 
 
563 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  27.86 
 
 
528 aa  100  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 
481 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  24.79 
 
 
510 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  33.51 
 
 
242 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.65 
 
 
556 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 
555 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.4 
 
 
554 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  24.24 
 
 
935 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  24.75 
 
 
530 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.73 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  24.69 
 
 
909 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.9 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.4 
 
 
554 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 
705 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  23.35 
 
 
644 aa  97.8  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  28.65 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0571  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 
554 aa  97.8  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  21.36 
 
 
913 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.8 
 
 
647 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  23.4 
 
 
628 aa  97.4  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  23.41 
 
 
628 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 
553 aa  97.4  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  27.27 
 
 
493 aa  97.4  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  34.41 
 
 
338 aa  97.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  22.8 
 
 
942 aa  97.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  25.2 
 
 
626 aa  97.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.7 
 
 
564 aa  97.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  20.79 
 
 
913 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  21.78 
 
 
913 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.8 
 
 
563 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  24.55 
 
 
610 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
555 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>