More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1375 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  68.85 
 
 		 444 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  69.63 
 
 		 439 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  77.12 
 
 		 445 aa  705    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  70.32 
 
 		 439 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  71.46 
 
 		 439 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 439 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 444 aa  914    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 438 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  68.78 
 
 		 444 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  70.25 
 
 		 439 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  69.79 
 
 		 439 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 440 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  69 
 
 		 443 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  65.75 
 
 		 439 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  69.04 
 
 		 435 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 440 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 		 442 aa  621  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  67.65 
 
 		 498 aa  618  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  69 
 
 		 442 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  67.35 
 
 		 441 aa  614  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  67.35 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 442 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 440 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  70.25 
 
 		 437 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 442 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  66.36 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  67.58 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 442 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 451 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 437 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 422 aa  488  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 585 aa  299  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 581 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 576 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 573 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 571 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 571 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 571 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 573 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 571 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 570 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 570 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 571 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 571 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 569 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 572 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 571 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 571 aa  289  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 574 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 578 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 576 aa  289  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  289  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 582 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  42.72 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 580 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 578 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 570 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>