More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0661 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  100 
 
 		 129 aa  259  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  77.52 
 
 		 129 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  66.41 
 
 		 130 aa  173  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  54.84 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  44.07 
 
 		 208 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  44.07 
 
 		 208 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  38.98 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  38.98 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  37.5 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  33.05 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  30.16 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  31.03 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  36 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  32.03 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  28.21 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.47 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.31 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  26.72 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.52 
 
 		 600 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  31.25 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  27.59 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  35.48 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  37.01 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 845 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.51 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.08 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 649 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.97 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.08 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  33.87 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.14 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  31.25 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  32.82 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  30.47 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.7 
 
 		 650 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  25.78 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  25.78 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.87 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  25.78 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  24.6 
 
 		 586 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  25.68 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  28.8 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.09 
 
 		 613 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  33.61 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  29.08 
 
 		 348 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 215 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  27.21 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 649 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>