More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3583 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  87.91 
 
 
306 aa  517  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  71.76 
 
 
311 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  71.76 
 
 
311 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  72.09 
 
 
311 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  54.77 
 
 
604 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  54.77 
 
 
604 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  54.77 
 
 
604 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  56.93 
 
 
586 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  53.63 
 
 
583 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  47.4 
 
 
301 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  42.51 
 
 
322 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  39.49 
 
 
313 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  46.43 
 
 
302 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  44.36 
 
 
310 aa  198  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  40.42 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  43.97 
 
 
313 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  44.33 
 
 
294 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 
320 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  41.82 
 
 
298 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 
302 aa  182  9.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  42.32 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
312 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  36.91 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 
296 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  32.57 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.23 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  32.28 
 
 
273 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
296 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 
275 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
513 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
296 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 
271 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
264 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.04 
 
 
312 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
275 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  32 
 
 
317 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
276 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  28.91 
 
 
281 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 
323 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 
286 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
248 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  28.84 
 
 
296 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
264 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 
254 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
281 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.1 
 
 
269 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
248 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
248 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
248 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
248 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 
268 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 
254 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
248 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.19 
 
 
248 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.12 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.5 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.14 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.3 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.19 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.06 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  36.21 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.62 
 
 
248 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
271 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  33.19 
 
 
501 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
269 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.6 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.6 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  31.8 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
237 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.43 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  27.43 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.19 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>