More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2505 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  100 
 
 
387 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  93.26 
 
 
387 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  71.39 
 
 
386 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  42.67 
 
 
394 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.45 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.45 
 
 
392 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.41 
 
 
392 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  42.2 
 
 
388 aa  275  7e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  41.78 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  40.46 
 
 
386 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  39.59 
 
 
390 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  38.56 
 
 
390 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  39.65 
 
 
390 aa  268  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  41.49 
 
 
387 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 
391 aa  264  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  40.66 
 
 
387 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  41.34 
 
 
392 aa  257  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  39.33 
 
 
387 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.36 
 
 
394 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
388 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.72 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.98 
 
 
387 aa  239  8e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  36.64 
 
 
396 aa  236  4e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.56 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.31 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.28 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.66 
 
 
384 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.8 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  36.15 
 
 
386 aa  222  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  39.06 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.82 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.34 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.63 
 
 
389 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.05 
 
 
388 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  36.76 
 
 
388 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
392 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
392 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  35.53 
 
 
387 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  38.28 
 
 
388 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  34.43 
 
 
404 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
392 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 
394 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.31 
 
 
395 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
392 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  38.9 
 
 
398 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.78 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.45 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.85 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  36.88 
 
 
388 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.83 
 
 
398 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.34 
 
 
383 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.85 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  35.7 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  34.2 
 
 
397 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  34.2 
 
 
397 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  34.2 
 
 
397 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  34.74 
 
 
413 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  34.74 
 
 
413 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.27 
 
 
378 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  35.55 
 
 
386 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.66 
 
 
413 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.92 
 
 
406 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  35.11 
 
 
412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.06 
 
 
386 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 
389 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  38.75 
 
 
397 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34 
 
 
413 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.82 
 
 
378 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.24 
 
 
376 aa  186  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  35.98 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.11 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.83 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  35.43 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
395 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.93 
 
 
392 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  36.5 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
401 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 
460 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  31.01 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.29 
 
 
398 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  34.77 
 
 
389 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  34.87 
 
 
381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  34.87 
 
 
381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  34.87 
 
 
381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  34.47 
 
 
396 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  35.52 
 
 
389 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  35.17 
 
 
398 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  37.68 
 
 
399 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  37.68 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  37.68 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  37.39 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.92 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.67 
 
 
413 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  31.66 
 
 
390 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  37.1 
 
 
399 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
389 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>