More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1491 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1491  short chain dehydrogenase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  87.98 
 
 
265 aa  413  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  84.55 
 
 
244 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  84.55 
 
 
244 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  84.55 
 
 
244 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  74.03 
 
 
259 aa  334  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.72 
 
 
267 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.49 
 
 
261 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  60.18 
 
 
252 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1386  short chain dehydrogenase  55.65 
 
 
256 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
257 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  48.5 
 
 
259 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 
256 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3623  short chain dehydrogenase  48.52 
 
 
280 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 
262 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2830  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 
247 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2066  short chain dehydrogenase  46.02 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
254 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2633  short chain dehydrogenase  48.88 
 
 
252 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522404  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
256 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
295 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.66 
 
 
251 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  36.84 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.85 
 
 
250 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.028348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  44.68 
 
 
286 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
275 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
262 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2236  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
266 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0079693  hitchhiker  0.0000000000146791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 
235 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
261 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.09 
 
 
323 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.09 
 
 
286 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
260 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.09 
 
 
286 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
253 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
258 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
266 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
256 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
252 aa  118  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
249 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.35 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.26 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.17 
 
 
247 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
244 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
262 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 
246 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
256 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
255 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.9 
 
 
247 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.79 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
256 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.62 
 
 
248 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.32 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
516 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 
248 aa  113  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0400  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.22 
 
 
247 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0215607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
257 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.48 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.52 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
256 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0092  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.9 
 
 
253 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
256 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
256 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
289 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
254 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0427  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>