More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0715 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 228 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 251 aa  305  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 251 aa  305  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 231 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  57.01 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  46.82 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  40.22 
 
 		 258 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  34.43 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.38 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.19 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.53 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>