More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4065 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  98.96 
 
 		 195 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  91.1 
 
 		 200 aa  339  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  76.47 
 
 		 192 aa  271  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  68.29 
 
 		 174 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  65.32 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  58.28 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  57.67 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  56.63 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  58.49 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  58.18 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  53.25 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  54.49 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  54.37 
 
 		 181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  52.07 
 
 		 178 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  49.71 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  53.09 
 
 		 172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  55.21 
 
 		 171 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  53.37 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  53.25 
 
 		 170 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  55.48 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  55.48 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  54.62 
 
 		 125 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  45.45 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  54.4 
 
 		 145 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  45.76 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  47.1 
 
 		 130 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  52 
 
 		 139 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  48 
 
 		 135 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  40.28 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  40.16 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  40.16 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  40.16 
 
 		 156 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.86 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  49.21 
 
 		 136 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  38.82 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  40.59 
 
 		 222 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  42.98 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.47 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  47.22 
 
 		 128 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.42 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  41.04 
 
 		 137 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  35.5 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  42.19 
 
 		 155 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  50 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  38.46 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  38.89 
 
 		 155 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  55.13 
 
 		 140 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  44.44 
 
 		 128 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  42.52 
 
 		 132 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  40.58 
 
 		 167 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40.85 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  33.73 
 
 		 855 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  40.15 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  35.44 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  35.44 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  33.1 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  40 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  33.82 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  35.95 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  33.82 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  33.82 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  38.52 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  41.23 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  30.73 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  35.66 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  30.65 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  40.87 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  34.88 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.1 
 
 		 870 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  32.05 
 
 		 469 aa  75.5  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  36.84 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  36.61 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  39.52 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.81 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  33.85 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.69 
 
 		 1030 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  37.59 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  36.13 
 
 		 490 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  36.75 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  38.79 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  37.96 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  30.65 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  36.75 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1402 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  34.81 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 1133 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.81 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  39.82 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37212  predicted protein  34.62 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  32.21 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  32.8 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>