99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0907 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  97.83 
 
 		 230 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  90.43 
 
 		 230 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  60.1 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  52.17 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  56.29 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  40.43 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  40.35 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  39.47 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  41.47 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  42.72 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  36.21 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  36.6 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  37.33 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  43.02 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  37.21 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  38.64 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  43.95 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  48.8 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  43.31 
 
 		 170 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  48.33 
 
 		 178 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  34.97 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2044  hypothetical protein  47.29 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0213707  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  47.5 
 
 		 170 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  45.16 
 
 		 178 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  45.83 
 
 		 169 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  45 
 
 		 169 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  39.84 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  45.13 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  39.02 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  33.91 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  38.52 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  38.84 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  32.16 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  37.31 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  32.94 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  39.02 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  34.71 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  41.8 
 
 		 174 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  31.76 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  36.59 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  41.05 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  34.12 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  34.5 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  34 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  36.21 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  34.4 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  38.14 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  31.53 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  36.61 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  37.61 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  33.58 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  32.28 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  30.17 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  29.74 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  37.98 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  36.75 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  36.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  32.09 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  30.12 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  33.9 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  34.56 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  29.51 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  35.51 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  29.38 
 
 		 177 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  34.85 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  33.1 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  28.18 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  31 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  29.89 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  30.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  33.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  28.46 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  28.46 
 
 		 185 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  30.51 
 
 		 172 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  29.61 
 
 		 165 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  34.68 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1803a  hypothetical protein  33.75 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  33.03 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  30.4 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  30.93 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  28.92 
 
 		 192 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0086  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>