78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0219 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  97.71 
 
 		 175 aa  316  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  88 
 
 		 175 aa  308  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  80.89 
 
 		 175 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  60.38 
 
 		 173 aa  200  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  62.66 
 
 		 172 aa  197  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  62.42 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  50.64 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  43.37 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  42.77 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  44.77 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  45.86 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  44.19 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  37.99 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  43.54 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  42.42 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  39.13 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  41.14 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  40.51 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  40.51 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  35.54 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  35.71 
 
 		 499 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  36.48 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  36.71 
 
 		 190 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  39.07 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  29.14 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  27.62 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  30.88 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  30.61 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  28.47 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  37.27 
 
 		 477 aa  60.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  26.84 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.48 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  34.74 
 
 		 645 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.61 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  35.05 
 
 		 640 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 642 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 642 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  34.69 
 
 		 642 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  34.02 
 
 		 640 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  29.21 
 
 		 136 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.65 
 
 		 653 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.93 
 
 		 649 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 388 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 388 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 657 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.84 
 
 		 632 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  36.14 
 
 		 629 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  25.45 
 
 		 702 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  25.45 
 
 		 702 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  37.36 
 
 		 653 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  30.11 
 
 		 643 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.67 
 
 		 632 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  35.37 
 
 		 636 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.15 
 
 		 637 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 647 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  33.72 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.71 
 
 		 644 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  26.75 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 631 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 647 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29.25 
 
 		 394 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  28.3 
 
 		 394 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29.25 
 
 		 394 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 393 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28.3 
 
 		 394 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  28 
 
 		 373 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  33.77 
 
 		 633 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  27.45 
 
 		 259 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  27.45 
 
 		 259 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  27.45 
 
 		 259 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>