More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0208 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  98.11 
 
 		 318 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  91.99 
 
 		 318 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  79.49 
 
 		 322 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  80.52 
 
 		 321 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  75.4 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  75.4 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  75.4 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  66.99 
 
 		 316 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  62.7 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  60.97 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  60.91 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  60.52 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  58.31 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  58.58 
 
 		 317 aa  355  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 323 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  54.6 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 319 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  54.29 
 
 		 319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  55.03 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 321 aa  331  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  54.06 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  53.7 
 
 		 318 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  49.2 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  47.76 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  46.28 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  46.75 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  43.91 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.31 
 
 		 338 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  42.36 
 
 		 338 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  45.35 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  46.47 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.45 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  44.08 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  38.29 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  37.98 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>