268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4272 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4272  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  49.09 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6277  hypothetical protein  47.1 
 
 		 304 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11907  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0237  putative NirV protein  47.23 
 
 		 290 aa  241  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0261  NirV protein, putative  47.23 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4624  protein of unknown function DUF323  45.1 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  44.73 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1596  hypothetical protein  49.21 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  29.74 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 657 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 654 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.16 
 
 		 616 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 		 570 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  27.67 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  27.9 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  29.78 
 
 		 523 aa  72.8  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.89 
 
 		 497 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  26.88 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  25.5 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  31.11 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.8 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  27.6 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 		 698 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  24 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.85 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  34.75 
 
 		 1053 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  30.77 
 
 		 965 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.87 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  32.03 
 
 		 1049 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  30.3 
 
 		 1186 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  23.2 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  24.22 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1196 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  25.94 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  31.72 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  34.19 
 
 		 960 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  23.62 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 		 1007 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  30.23 
 
 		 775 aa  59.3  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.17 
 
 		 1041 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  33.71 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  25.09 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  33.06 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.87 
 
 		 1023 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  27.55 
 
 		 416 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.2 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  28.79 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.74 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.22 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  23.69 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  33.04 
 
 		 923 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.75 
 
 		 1044 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  37.62 
 
 		 605 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.27 
 
 		 628 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26 
 
 		 586 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  34.51 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  32.14 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  34.53 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  33.03 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  31.62 
 
 		 957 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  33.91 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  27.54 
 
 		 802 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  26.29 
 
 		 929 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  30.34 
 
 		 781 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  29.9 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 637 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  27.14 
 
 		 1201 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  26.44 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.27 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1818 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  26.2 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 		 1049 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  22.6 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  32.76 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 		 1392 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 617 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  29.95 
 
 		 600 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1492 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 		 1132 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  31.02 
 
 		 549 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 829 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>