More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3634 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
336 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654938  hitchhiker  0.00239439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
314 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
317 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
317 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000749118 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
317 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
317 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
314 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.63 
 
 
313 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0789  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, innermembrane subunit  43.04 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445357  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
317 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
317 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.89 
 
 
318 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
313 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5663  ABC transporter membrane spanning protein  38.39 
 
 
318 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.46 
 
 
313 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
329 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
313 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
318 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
315 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
319 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
316 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
320 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.1 
 
 
305 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
316 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.570191  normal  0.169203 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
316 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551885 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
325 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.725204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  38.1 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
317 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
315 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
317 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.0574372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
318 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.054126  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
305 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
313 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
315 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1496  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 
317 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592571  hitchhiker  0.00104158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.13 
 
 
308 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
334 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
318 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0250  peptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
318 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1923  ABC transporter permease  36.13 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887437  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
318 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
315 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.506454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
318 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
315 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
318 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
318 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
315 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0156  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.82 
 
 
318 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383247  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.82 
 
 
313 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
306 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
323 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.758798  normal  0.425001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  38.38 
 
 
298 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
320 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
321 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0787  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.37 
 
 
317 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
308 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
334 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
316 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.82 
 
 
314 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.63 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
313 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3714  nickel ABC transporter permease(nikB)  37.03 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
321 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149642  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3523  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0138063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.59 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00925001  normal  0.561279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.23 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.23 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.85 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  36.91 
 
 
313 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
318 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
314 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
321 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
321 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
313 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.62 
 
 
316 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 
314 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
313 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  33.23 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>