220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0337 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  36.27 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.05 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.96 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  33 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0155  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 247 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 447 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.53 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.68 
 
 		 271 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  25.18 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  23.86 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 416 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  26.33 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  26.36 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.55 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  27.55 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  27.55 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  27.55 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  27.55 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.65 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  27.78 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  29.25 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 504 aa  87  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.56 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  24.94 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  27.84 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  30.03 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.03 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  29.95 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.14 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.17 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28.99 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  26.68 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  35 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  26.8 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  25.25 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  26.8 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  27.95 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  26.42 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  26.42 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  26.42 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  27.44 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>