More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2334 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  82.05 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  58.05 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  58.05 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  56.6 
 
 		 234 aa  256  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  54.47 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.63 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  53.19 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  56.22 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  58.3 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.68 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  56.36 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  56.65 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.38 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  51.72 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  52.16 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  55.17 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  52.77 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.34 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.93 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  51.91 
 
 		 240 aa  237  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 237 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.32 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.08 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.74 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  51.08 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  51.72 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  52.59 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  51.07 
 
 		 264 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  51.69 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  53.02 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.57 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.95 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.63 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  52.16 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 		 244 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  52.79 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.07 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  51.72 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.92 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.34 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  49.57 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2041  ABC transporter related  46.32 
 
 		 388 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  51.54 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.94 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  48.54 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.94 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.94 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  48.07 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.38 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  50.87 
 
 		 239 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.87 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.93 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  54.31 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.86 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  49.35 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.13 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.52 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.32 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  51.3 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.93 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  49.14 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  53.04 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>