77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2325 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2325  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 920 aa  1771    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1658  TPR repeat-containing protein  65.47 
 
 		 870 aa  985    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0923542  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 993 aa  174  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1097 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  26.88 
 
 		 1094 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  27.82 
 
 		 1095 aa  104  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  26.47 
 
 		 1083 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.7 
 
 		 900 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.85 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.35 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  25 
 
 		 887 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  23.86 
 
 		 954 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  25.4 
 
 		 896 aa  64.3  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  25.74 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.03 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.03 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.47 
 
 		 1111 aa  60.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.58 
 
 		 901 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  29.61 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.24 
 
 		 1055 aa  58.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.68 
 
 		 1108 aa  57.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  24.03 
 
 		 969 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.82 
 
 		 914 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.64 
 
 		 919 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.17 
 
 		 914 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  26.71 
 
 		 913 aa  54.3  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.25 
 
 		 1204 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.84 
 
 		 928 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  23.88 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 907 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.52 
 
 		 902 aa  52.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 902 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  26.04 
 
 		 1163 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1442  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.72 
 
 		 291 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  26.11 
 
 		 907 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  24.37 
 
 		 1070 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  28.79 
 
 		 1064 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.07 
 
 		 904 aa  51.6  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  24.49 
 
 		 878 aa  51.2  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 947 aa  51.6  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 907 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.05 
 
 		 947 aa  51.2  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.26 
 
 		 921 aa  50.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.08 
 
 		 914 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  23.29 
 
 		 977 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.79 
 
 		 749 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.37 
 
 		 947 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.35 
 
 		 1071 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 		 1021 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.49 
 
 		 895 aa  48.5  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  22.58 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  23.64 
 
 		 901 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  22.58 
 
 		 901 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  23.64 
 
 		 901 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  23.64 
 
 		 901 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  23.64 
 
 		 901 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  22.58 
 
 		 901 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  23.64 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 906 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  24.89 
 
 		 901 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 906 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 917 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 898 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 917 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 917 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  27.08 
 
 		 921 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 917 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  25.4 
 
 		 717 aa  45.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.21 
 
 		 925 aa  45.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.05 
 
 		 900 aa  44.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  47.37 
 
 		 766 aa  44.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>