More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0174 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
615 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 
606 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 
606 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  55.44 
 
 
605 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.7 
 
 
606 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  55.61 
 
 
602 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.94 
 
 
608 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.94 
 
 
608 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  55.67 
 
 
609 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 
613 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 
608 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.46 
 
 
602 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  55.18 
 
 
609 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
632 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 
609 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 
606 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.13 
 
 
602 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
605 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 
606 aa  634    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
615 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
616 aa  665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  56.3 
 
 
603 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  54.76 
 
 
615 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
606 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  57.55 
 
 
605 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  54.77 
 
 
610 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 
600 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
595 aa  1203    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 
601 aa  636    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
605 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  64.08 
 
 
593 aa  770    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.36 
 
 
614 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  54.19 
 
 
623 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  89.24 
 
 
595 aa  1099    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
610 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 
610 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 
608 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 
606 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 
603 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.2 
 
 
603 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 
602 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
605 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  55.44 
 
 
605 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 
606 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  55.44 
 
 
602 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 
610 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  55.67 
 
 
609 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 
608 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  55.11 
 
 
611 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 
603 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.04 
 
 
602 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
606 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 
603 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 
608 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 
599 aa  633  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
606 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  54.88 
 
 
608 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 
606 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 
616 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
608 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
600 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 
598 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
603 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.52 
 
 
609 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  52.86 
 
 
600 aa  631  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  53.83 
 
 
608 aa  631  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
603 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 
607 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 
607 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 
598 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.44 
 
 
606 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
608 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
608 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.7 
 
 
603 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.59 
 
 
614 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
609 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
609 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
592 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
608 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.96 
 
 
603 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  54.36 
 
 
604 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  52.42 
 
 
614 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
608 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
608 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.59 
 
 
614 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  55.32 
 
 
608 aa  628  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
608 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
608 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>