More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2459 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  100 
 
 
513 aa  994    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  58.05 
 
 
522 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  60.04 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  47.67 
 
 
490 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  44.23 
 
 
660 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  44.12 
 
 
607 aa  362  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  45.51 
 
 
531 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  42.95 
 
 
557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 
552 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  43.61 
 
 
487 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  41.92 
 
 
486 aa  323  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  42.16 
 
 
596 aa  319  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  44.23 
 
 
516 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  40.38 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  40.38 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  40.79 
 
 
506 aa  312  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  39.26 
 
 
572 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  38.41 
 
 
483 aa  312  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  40.93 
 
 
540 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  43.67 
 
 
458 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  42.91 
 
 
533 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  43.58 
 
 
517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  41.24 
 
 
483 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  41.16 
 
 
566 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  42.23 
 
 
467 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  48.1 
 
 
502 aa  289  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  42.71 
 
 
486 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  44.35 
 
 
485 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  43.3 
 
 
493 aa  279  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  36.51 
 
 
509 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  40.35 
 
 
478 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  40.21 
 
 
491 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  40.17 
 
 
481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.41 
 
 
522 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  40.89 
 
 
495 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  35.55 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  37.02 
 
 
466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  38.04 
 
 
509 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.16 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  34.86 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  34.85 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  36.2 
 
 
531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  34.45 
 
 
499 aa  217  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  34.97 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  33.84 
 
 
456 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  31.73 
 
 
447 aa  208  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  33.06 
 
 
456 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  35.22 
 
 
474 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  33.84 
 
 
464 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  35.37 
 
 
473 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  34.71 
 
 
534 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  34.71 
 
 
534 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  34.55 
 
 
457 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  34.49 
 
 
534 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.19 
 
 
463 aa  203  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  33.92 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  33.41 
 
 
464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  34.05 
 
 
465 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  33.76 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  33.48 
 
 
453 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  33.26 
 
 
482 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  33.41 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  33.63 
 
 
466 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  33.63 
 
 
466 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  33.18 
 
 
466 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  32.67 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  33.63 
 
 
462 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  32.06 
 
 
466 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  32.4 
 
 
467 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  32.84 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  31.97 
 
 
467 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  32.09 
 
 
454 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  29.37 
 
 
456 aa  179  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  29.67 
 
 
475 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  31.05 
 
 
459 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  31.05 
 
 
459 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  29.07 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  33 
 
 
472 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.94 
 
 
487 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  30.13 
 
 
482 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  30.75 
 
 
472 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  28.94 
 
 
498 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  31.16 
 
 
478 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.56 
 
 
446 aa  153  8e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  31.22 
 
 
471 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  30.21 
 
 
491 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  31.73 
 
 
474 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  31.16 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.1 
 
 
459 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.91 
 
 
482 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  31.44 
 
 
579 aa  141  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  28.54 
 
 
483 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  33.33 
 
 
476 aa  139  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  29.41 
 
 
471 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  30.57 
 
 
511 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  29.5 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  29.48 
 
 
446 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.5 
 
 
493 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  28.07 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>