230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2045 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  725    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  70.83 
 
 
359 aa  532  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  70.39 
 
 
359 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  63.61 
 
 
359 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  56.91 
 
 
360 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  54.91 
 
 
356 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.37 
 
 
357 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
351 aa  351  8e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 
353 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.28 
 
 
352 aa  332  5e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.73 
 
 
350 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.88 
 
 
354 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.14 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  51.74 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
354 aa  269  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 
351 aa  249  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.77 
 
 
351 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 
342 aa  237  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  42.68 
 
 
347 aa  235  9e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 
342 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.72 
 
 
358 aa  232  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.12 
 
 
341 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 
334 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  41.63 
 
 
355 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  41.46 
 
 
356 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  40 
 
 
349 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 
355 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.82 
 
 
334 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.71 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.78 
 
 
352 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.68 
 
 
334 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  35.63 
 
 
352 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.62 
 
 
334 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.17 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  30.39 
 
 
403 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  39.68 
 
 
349 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.39 
 
 
399 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  26.82 
 
 
353 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.27 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  34.48 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.88 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.42 
 
 
349 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  35.38 
 
 
419 aa  115  8.999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.67 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  30.21 
 
 
397 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.29 
 
 
405 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  32.16 
 
 
451 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  32.46 
 
 
418 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.77 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.87 
 
 
454 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  30.87 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  30.87 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  28.11 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  29.87 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  29.12 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  28.22 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  27.83 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  29.43 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  29.06 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  28.75 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  28.44 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  28.44 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.08 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  27.05 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  26.84 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  27.87 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  25.65 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  27.13 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  25.36 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  29.13 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  26.16 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  28.21 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>